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细菌是最常见的病原体，细菌的种类和分布因感染类型、医院类别、病人具体情况和治疗措施不同而异 目前医院感染的病原菌以革兰阴性杆菌为主，如肠杆菌和非发酵菌，这些细菌常有耐药性 近年来随着抗生素的大量使用，革兰阳性球菌感染，特别是耐甲氧西林金黄色葡萄球菌感染、凝固酶阴性葡萄球菌感染正在增加 厌氧菌和深部真菌等机体正常菌群常引起内源性感染 真菌感染正在增加
志贺痢疾杆菌 福氏痢疾杆菌 舒密次痢疾杆菌 鲍氏痢疾杆菌 宋内痢疾杆菌
痢疾志贺菌1型 福氏志贺菌 鲍氏志贺菌 鲍氏志贺菌2型 痢疾志贺菌2型
痢疾志贺菌l型 福氏志贺菌 鲍氏志贺菌 鲍氏志贺菌2型 痢疾志贺菌2型
痢疾忠贺菌1型 福氏志贺菌 鲍氏志贺菌 鲍氏志贺菌2型 痢疾志贺菌2型
溶血性链球菌 沙眼衣原体 葡萄球菌 厌氧菌 肠球菌
军团菌 空肠弯曲菌 结肠炎耶尔森菌 幽门螺杆菌 以上均是
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