转录因子DNA结合域常见形式有

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含有转录终止信号的DNA序列 DNA分子中能转录的序列与阻遏蛋白结合的DNA序列转录启动时RNA聚合酶识别与结合的DNA序列与反式作用因子结合的RNA序列

所有转录因子结构均含有DNA结合域及转录激活域有些转录因子可能含有DNA结合域或转录激活域通过DNA-蛋白质或蛋白质-蛋白质相互作用发挥作用大多数转录因子的调节作用属反式调节

都与相同的激素结合与DNA的结合不是序列特异的与锌结合的保守序列不同于锌指蛋白通过第二“指”C端的氨基酸形成二体结构转录激活与DNA和激素结合分别由不同的结构域完成

所有转录因子结构均含有DNA结合域和转录激活域有些转录因子结构可能含有DNA结合域或转录激活域转录因子调节作用是DNA依赖的或DNA非依赖的通过DNA－蛋白质或蛋白质－蛋白质相互作用发挥作用大多数转录因子的调节作用属反式调节

锌指结构螺旋-环-螺旋富含脯氨酸结构域亮氨酸拉链

效应物分子可以促进转录因子与DNA结合效应物分子可以抑制转录因子与DNA结合去阻遏作用使转录速度增加转录因子只能起阻遏因子的作用